
2023年4月2日,西班牙科尔多瓦大学Tomas Cerdo等人在Cell Host & Microbe(IF=30.3, 2023)杂志发表了题为“Infant gut microbiota contributes to cognitive performance in mice”的文章。研究人员使用16S rRNA测序、宏蛋清质组学和基础代谢组学分折揭示了婴儿认识和肠道菌群之间的联系。结果显示认识能力较好的婴儿肠道菌群可以增强小鼠的记忆,并调节了小鼠外周血皮层(PRC)的组氨酸代谢组,这些结果表明“肠脑轴”在婴儿时期就起到至关重要的作用。
英文版一级标题:Infant gut microbiota contributes to cognitive performance in mice (Cell Host & Microbe,IF=30.3, 2023)
中文翻译文章标题:婴儿肠道微生物群有助于小鼠的认知表现
组学技艺:16S rRNA+宏蛋白质组学+代谢组学
样本量数据:婴儿粪便、小鼠粪便
探究工作思路
(图源:Tomas Cerdo, et al., Cell Host & Microbe. 2023)
其主要的研究结论
01、宝宝认识到技能和消化道菌群成分的直接关系
首先,研究人员基于贝利婴儿发育量表(BSID-III)数据,根据6个月大的婴儿在复合认识、语言和运动三个领域的得分,将婴儿分为高于中位数组和低于中位数组。通过对婴儿粪便样本进行16S rRNA分析,发现唯一与肠道微生物群落结构密切相关的BSID-III量表是复合认识(CC)。 与低过CC中五五位数组(Inf-belowCC)的孩子相比较,超过CC中五五位数组(Inf-aboveCC)的孩子肠内菌群具更高一些的不光滑性( 图1A)。在属水平上,Inf-aboveCC组的肠道菌群中杆菌、链球菌、拟副杆菌、严格感梭菌、霍氏杆菌和瘤胃球菌富集,而无毛螺科、嗜血杆菌和乳球菌的显著减少(图1B-D)。上述结果表明, 认识到专业能力不一样的的小宝宝,其肠腔微动物在群落结构类型共同点上来源于更为明显差别的 。
图1. Inf-aboveCC和Inf-belowCC组幼儿肠子菌好友分组成结构类型
02、新生儿相识力有关的的宏蛋清质组特点
为了探究与婴儿认识相关的肠道菌群功能特征,研究人员采用宏球蛋白组学对婴儿粪便进行分析。结果表明,Inf-belowCC组的肠道菌群富含参与细胞内运输分泌和囊泡运输的蛋白质,而Inf-aboveCC组中参与碳水化合物运输和代谢的蛋白质有增加的趋势。稀疏偏最小二乘判别分析(sPLS-DA)图显示,婴儿宏蛋白质组(图2A)和促进区分的已鉴定蛋白质组(图2B)之间存在明显区别。组氨酸酶(HutH)是Inf-aboveCC宏白质组中主要为显著生物富集的核胆固醇。随后,研究人员通过DESEq2差异丰度分析(图2C)和Wilcoxon检验进一步证实了上述结果,组氨酸分解代谢的两种下游酶尿糖酸脱水酶(HutU)和咪唑酮丙酸酶(HutI)在Inf-above CC宏蛋白质组中丰度较高。上述分析结果揭示了与婴儿认识能力相关的宏蛋白质组特征。
图2. 宏蛋白质组学含有概述
03、组氨酸消化吸收与产品的认知性能关与
宏蛋白质组学数据和生化实验结果表明婴儿组氨酸代谢与认识能力相关,因此,研究人员开发一种靶向治疗分解代谢组学方法用于定量分析组氨酸代谢物水平(图3A)。结果表明Inf-aboveCC组婴儿粪便中的尿酸盐水平显著降低,而其余组氨酸代谢物则无差异(图3B)。研究人员进一步检测了婴儿尿液中的组氨酸代谢物,结果显示与Inf-belowCC相比,Inf-aboveCC组婴儿尿液中组胺、组氨酸和尿酸水平显著升高(图3C),且Inf-aboveCC组粪便中的尿酸盐/组氨酸比值(图3D)和尿液中的组胺/尿酸盐比值(图3E)显著降低。粪便中的尿酸盐/组氨酸比值与unclass_lachnospirace_41和Lachnospiraceae incertae sedis属呈负相关,与Bacteroides_3呈正相关(图3F)。尿液中的组氨酸水平与Streptococcus_42和Bacteroides属呈正相关,而尿酸水平与Holdemanella_16呈负相关,与链球菌属呈正相关(图3G)。
图3. 组氨酸代谢率与宝贝的认知效果有关
04、宝宝供体的肠子菌群小鼠复制
最后,为了调查肠道微生物群是否有助于认知,研究人员进行了一项粪便微生物群移植(FMT)实验。结果表明,将Inf-aboveCC供体的粪便移植到GF小鼠体内,其记忆功能优于Inf-belowCC供体的小鼠(图4)。被婴儿肠道菌群定植的小鼠拥有与记忆功能相关的不同细菌分类群,认知表现较好的婴儿微生物群小鼠表现出更高的记忆功能,包括Phocaeicola, Bacteroides和Bifidobacterium物种在内的丰富分类群以及不同的组氨酸代谢组学特征(图4B),其中,毛缕菌科和拟杆菌类与婴儿认知的关联在人源化小鼠中得到了复制。此外,与接受Inf-belowCC肠道微生物组的小鼠相比,使用Inf-below cc肠内枯草芽孢杆菌技术组的小鼠HutH几丁质酶因此会高。总之,这些结果表明通过婴儿供体的肠道菌群粪便移植的记忆功能可以传播给GF小鼠,表明肠道菌群可以作为一种促进记忆的实体。
图4. 被新生宝宝肠腔菌群定植的小鼠拥用与记忆力工作涉及到的有差异 细菌病毒归类群
总结ppt
所述,科学探析员在16S rRNA测序、宏蛋白酶质组学和细胞基础产生组学了解确立了新生宝宝组氨酸细胞基础产生组与的了解左右的沟通,消息队列现了了个与理解了解本事对应的细胞基础产生酶—组氨酸酶(HutH)。HutH关卡的不一致性同时各种不同的排泄物和排尿组氨酸细胞基础产生组与新生宝宝的了解光于。显然,在新生宝宝供体的肠腔菌群排泄物囊胚迁移的遗忘功能性能够 散播给没有微生物小鼠,理解了解本事比较的新生宝宝供体囊胚迁移小鼠中含Phocaeicola, Bacteroides和Bifidobacterium等与的了解本事光于的微生物。科学探析表面新生宝宝pp的了解和肠腔菌微博黑名单成左右的有关起初在6八个月时就确立开来了,组氨酸细胞基础产生物关卡的缓解是一种种风险的工作机制。拜谱总结
本研究通过16S rRNA测序和宏蛋清质组学分析使组氨酸酶在婴儿认识中的作用脱颖而出,并通过代谢组学和粪便移植的方法进一步验证,着力具体分析了在宝宝-畜禽粪便冻胚移植小鼠管理体制中肠腔菌群对群体行为力的干扰,为“肠脑轴”在宝宝期的壮大和使用长效机制出示了新的解释。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供蛋白质组学、代谢组学、修饰组学、16S rRNA测序等多组学技术,结合组学技术拜谱生物也推出了针对不同样本和研究领域的多组学研究方案,包括肠道篇、血液篇、医学篇等,帮助客户解决研究难题,助力多篇高分文章的发表,欢迎大家咨询!
参阅学术论文:Tomas C, Alicia RR, Inmaculada A, et al. Infant gut microbiota contributes to cognitive performance in mice. Cell Host & Microbe. 2023, 31(12): 1974-1988. doi: 10.1016/j.chom.2023.11.004.