
2024年9月由常州农林业大学考研张万刚硕士生导师的团队在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱怪物为该研究提供了亚硝基化表达组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
2英文标题格式:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
期刊论文:Journal of Agricultural and Food Chemistry
202历经四年后果因素:5.7
撤稿周期:2024年9月
消费者公司的:南京农业大学
研究探讨用料:蛋白
拜谱提拱高技术:亚硝基化修饰组学
水平路径:
一、学习效果
01.Caspase-3活性酶类
近些年尚不非常清楚NO对caspase-3的减弱反应能不能归因于NO介导的S-亚硝基化,各不相同氧浓度等度的GSNO看做外源性NO出售,以引发caspase-3的身体S-亚硝基化。结杲反映出,与没得GSNO的组相对于,100、200和400μM GSNO组的caspase-3化学活化偏态减轻(图1),与此前报导不符。GSNO处理减轻caspase-3化学活化的隐藏的诱因仍亟需阐释。
图1 不一氧化还原电位的GSNO工作对caspase-3催化活性的影响到
02.Caspase-3的S-亚硝基化层面
深入分析Caspase-3的亚硝基化层面,以揭示GSNO对Caspase-3的不起作用性。经GSNO加工后,查重到caspase-3淀粉酶S-亚硝基化抗压强度加剧(图2)。这个结杲认为,外源性GSNO培養可取得胜利分析caspase-3的身体外S-亚硝基化。可笑惊愕的是,在是没有GSNO的存在的较组中查重到一名暗淡的S-亚硝基化带,这认为caspase-3可能会时有发生内源性的S-亚硝基化。除外,本深入分析中caspase-3的S-亚硝基化层面较高,而caspase-3的生物大幅度降低,这与此前的深入分析一样。殊不知,caspase-3的活性朋友S-亚硝基化突显位点尚不清理,还应该下一步骤的科学探索。
图2 GSNO补救对caspase-3S-亚硝基化关卡的的影响
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化呈现组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的队列。橙色标签的队列透露S-亚硝基化肽,红标签的C透露S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱图
04.S-亚硝基化Caspase-3降解塑料结血清
结核球核核淀粉酶作为一个一项根本的体上皮细胞骨架核球核核淀粉酶,在达到肌体上皮细胞构成的构成完好的详细详细性和紧缩性管理方面起着根本影响,学习S-亚硝基化caspase-3对结核球核核淀粉酶挥发的铭感性认识具备根本效果。与Std(未用胱天核球核核淀粉酶酶-3和GSNO孵育的缺省肌化学纤维材料核球核核淀粉酶)组不同之处,0 μM GSNO组(肌原化学纤维材料和caspase-3的孵育,无GSNO)的完好的详细详细结核球核核淀粉酶份量强势消减,提示信息caspase-3对结核球核核淀粉酶具备潜在性的核球核核淀粉酶水解反应业务能力。在GSNO孵育后,完好的详细详细结核球核核淀粉酶的份量特别增长(P < 0.05)。前者,当GSNO浓硫酸浓度身高时,完好的详细详细结核球核核淀粉酶的份量延续上浮(P < 0.05)(图5)。某些察觉阐明,SNO掩盖的caspase-3以品质依懒的玩法缓和结核球核核淀粉酶的挥发。
图5.S-亚硝基化caspase-3可降解结蛋白酶
05.S-亚硝基化Caspase- 3挥发肌钙核蛋白-T
肌钙血清-T (TnT)是原肌球血清设定主管肌肉群缩紧的丝条的都要肌原钎维血清。TnT的吸附有特点是检侧到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化前提下,caspase-3对TnT的吸附前提如6已知,与Std组(富含caspase-3和GSNO的肌原钎维)好于,caspase-3组中30 kDa TnT精彩细节描写更为很深添加,显示caspase-3直接参与了TnT的吸附,还有就是,caspase-3与GSNO的孵育导至30 kDa TnT急剧下降。在100和200 μM GSNO组彼此如果没有检侧到很深的差别的(P > 0.05),而当GSNO的含量可达400 μM 时,该精彩细节描写更为很深减轻(P < 0.05)。这部分遇到显示了SNO装饰的caspase-3对TnT吸附的抑做用效果。结血清和TnT是caspase-3的敏感性底物,而GSNO治疗减低caspase-3的催化活性酶类或者导至肌原钎维血清吸附方面减低。由此可见经验,NO分析的S-亚硝基化都可以进行装饰半胱氨酸残基来设定caspase-3的催化活性酶类,而使进一次反应其对结血清和TnT的血清油脂水解水平,可以反应牛肉片的质量。
图6. S-亚硝基化caspase- 3吸附肌钙血清-T
二、个人心得体会
本研发最终得以研讨S-亚硝基化对caspase-3体现的会决定还有陆陆续续对鸡肉肌原植物钎维体内生物降解的会决定。蛋清S-亚硝基化能够体现caspase-3的半胱氨酸残基,最终得以影响caspase-3亲水性消减,进一歩限制了其对鸡肉肌原植物钎维蛋清的蛋清溶解力。三、拜谱个人总结
科学科研主要包括了酶活法测,亚硝基化绘制组学科研分析,WB等探测措施,找到球蛋白酶质酶S-亚硝基化就可以绘制caspase-3的半胱氨酸残基,这出现了caspase-3活力的影响,齐头并进步骤调节了其对鸡肉肌原合成纤维球蛋白酶质酶的球蛋白酶质酶蛋白酶质水解力。本科学科研为释意球蛋白酶质酶质亚硝基化对肉肥的监测制度化可以提供好几个个新的视野。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的核蛋白酶组学、呈现核蛋白酶组学、消化吸收组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸类型成品,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺硝化作用、total阳极氧化恢复原、分散巯基,欢迎大家咨询!
选取学术论文:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663