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项目文章(Cancer Letters IF:10.1)|从糖代谢到表观遗传:肝癌进展的隐藏引擎

发布时间:2025-11-21
分解分解消化吸收重语言编程是淋巴淋巴淋巴肿瘤再次发生和进展情况的象征,红提葡萄糖粉分解分解消化吸收的改变了起着管理的本质影响。这类变化使淋巴淋巴淋巴肿瘤组织会快捷调用能源并引发须得的分解分解消化吸收中体,若想可以支持怎强种子发芽。其实含有必要积极意义,但淋巴淋巴淋巴肿瘤组织调涨糖酵解的缘由仍不怎么知道。

近日,南京市医科社会一是附设医院医生王学浩院士评选创业团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,淀粉酶互作组和靶点体力分泌检测分析服务。

英语翻译主题词:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)

汉语网站标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路

加盟商基层单位:南京医科大学

科学研究用料:细胞

拜谱带来服务质量:转录组测序+球蛋白互作组+靶向治疗能量是什么消化吸收组

方法路线地图:

设计最终

01、YBX1被签别为HCC中糖酵解的根本染色体

本科学研究采样HCC肿癌子样本(n=7)的单神经元膜RNA测序动态数据显示集进行探讨,看见糖酵解特异性核心多在肿癌神经元膜中,hdWGCNA探讨识别系统出9个遗传基因引擎(图1A-G)。TCGA-LIHC链表的求求生存探讨认定YBX1为独有求求生存风险性缘由(图1H)。深化一个脚印综合IHC、WB试验和肿癌组织性性与挨近非肿癌组织性性的个人空间转录组学动态数据显示集断定YBX1是肝神经元膜癌治疗方法的存在靶点(图1I-K)。

图1:YBX1被设定为调整HCC组织糖酵解的至关重要缘由

02、YBX1驱动HCC中的有氧糖酵解和增值能力

为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向疗法能源分解代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。

图2:YBX1催进HCC中的有氧糖酵解和繁殖

03、OGT与YBX1紧密联系并有利于YBX1的O-GlcNAc糖基化

为了识别YBX1的调控因子,蛋白质互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。

图3:OGT与YBX1切合并加速YBX1的O-GlcNAc糖基化

04、YBX1的O-GlcNAc糖基化提高其磷碱化,导致推动其核转位

进每步骤查测YBX1的O-GlcNAc糖基化要不要后果其磷硝化作用,在OGT敲低的HCC人体细胞膜中或用OGT可抑注射剂OSMI-1治疗,YBX1血清能力同质性大幅度降低,YBX1磷硝化作用同质性提高(图4A-C)。IP科学实验现示,在是一样的的Flag-YBX1底物能力下,YBX1-WT的磷硝化作用能力同质性高过YBX1-T57A,是因此磷硝化作用的加剧不单单仅是因此更快的YBX1血清表答(图4D)。拆分了核和质成分找到TMG治疗的HCC人体细胞膜中YBX1核表答的上升(图4E-F),进每步骤找到YBX1磷硝化作用的关键性调高系数是AKT(图4G-I)。这么多找到重视O-GlcNAc糖基化借助催进其磷硝化作用来催进YBX1血清稳定可靠性并催进核转位。

图 4.YBX1的 O-GlcNAc 掩盖有助于其进几步产生磷硝化作用掩盖并可能带动其核转位

05、YBX1驱动PKM2转录

前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。

图 5.YBX1使得PKM2转录

06、YBX1 才能提高了组蛋清乳过酸突显平均水平

研究探讨挖掘YBX1敲低不错拉低蛋清质乳酸性反应,非常是H3K18乳酸性反应(图6A-C)。糖酵解可抑中药制剂2-DG的实验英文得知了糖酵解与组蛋清乳酸性反应的直观相关联,可可以抑制糖酵解可不错拉低H3K18la水准(图6D)。PKM2过描述可逆反应转YBX1敲低所导致的的H3K18la下调,到外源乳酸整理不光完善H3K18la,还随之YBX1描述上浮,提示卡存在的正向着评价(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR得知,H3K18la顺利通过丰度于YBX1开启子直观开展其转录,该操作过程受O-GlcNAc糖基化控制(图6H-J),并挖掘P300 上浮是YBX1开展H3K18乳酰化成用的长效机制(图6K-L)。

图6.YBX1增强学习H3K18乳酸性反应淡化程度

一篇文章工作小结

在此项探析中了解了YBX1在HCC中高形容,但是与糖酵破解切想关。YBX1在T57处被O-GlcNAc体现,为了稳定性高蛋清质并增长其形容。这样体现还资料YBX1在T57处的磷酸性反应,资料其核易位。故此,这一种步骤资料了糖酵解想关人类基因遗传的转录并促进乳酸的引发。不仅如此,YBX1激发P300的转录,以求win7驱动组蛋清的乳酸性反应,格外是H3K18la,H3K18乳酸性反应领域调空YBX1人类基因遗传转录(图7)。

图7.Y糖酵解-表观基因正负极馈环长效机制图

拜谱总结ppt

本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物工程为该研究提供了转录组测序,核蛋白互作组和靶向治疗能源消化吸收组技术服务,拜谱生物制品建立了完善成熟的转录组学、血清组学、翻譯后呈现组学、细胞代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!

参考资料文献综述

Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.
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