草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿装置常用见的妇科疾病之中。肾进行中CaOx晶状体过供大于求成型沉积会引起肾小管组织挤压伤和凋亡，得以引起肾结石的成型。短链脂质酸由肠管内好氧池疾病厌氧发酵营养膳食植物纤维引起，不只在整体肠管防线中起到用途，同时在装置标准上也起到重要性用途。进来，丁酸是最丰富多样的短链脂质酸，有抗感染和免疫系统遏制用途,本实验浅谈丁酸对CaOx肾结石的用途简答未知靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山专科医院泌尿整形科吴忠讲师、周子健教授于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠讲解、周子健研究生在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱海洋生物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了互联网药学学服务培训，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

文章标题命名：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 业主公司的：华山大医院 科研文本：大鼠、HK-2神经元 排列信息：对比组（Con）、模特组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱提供了枝术：wifi网络药理学学的检测

策略步奏图

的研究成果

实验工作员第一步搭建大鼠整治，在生物学生物化学指标图和安排病症学染色法等实验手法发现丁酸能能减轻CaOx整治大鼠肾CaOx硫化锌的建立和挫伤，缓解CaOx整治大鼠的细菌感染挫伤和钝化有机物的过重形容。另外，丁酸还可控制草酸成脂的HK-2细胞系核挫伤、钝化应激状态和细胞系核凋亡。 为探究式丁酸组成和靶表观遗传遗传网洛，探析工人从PubChem得到 丁酸和丁酸酯的二维和三维图像组成（图1A）。用PharmMapper数剧库和Uniprot数剧库解决后共需求出116个丁酸靶表观遗传遗传供进一歩概述。将表观遗传遗传所有使用STRING数剧库，使用PPI网洛概述。Cytoscape如下了去重复的前20的交通核心区站靶表观遗传遗传的详细的网洛图，属于CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。这个交通核心区站表观遗传遗传与网洛中的别的表观遗传遗传均特征出一定的的相应的性，原因研究分析这个表观遗传遗传概率表现出着协同作战不起做用。GO和KEGG概述证明了丁酸交通核心区站表观遗传遗传的相应的前提条件和菌物学基本功能（图1C）。交通核心区站表观遗传遗传常见与类固醇的荷尔蒙回应、空气氧化物应激性性回应、抗逆性氧血细胞对类固醇的荷尔蒙刺激做用的不起做用和对酸碱性化学反映元素的不起做用想关。上述讲到阐明，这个交通核心区站表观遗传遗传常见操作了空气氧化物应激性性和对抗逆性氧的菌物不起做用时，是肾结石产生体制中至关首要的前提条件，这反映出丁酸概率在肾结石中表现出首要不起做用。

图1| 丁酸型式与靶染色体互联网研究(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进两步探险丁酸对CaOx肾结石.切靶染色体，调查者管理充分利用GEO数据表格表示库对GSE73680中绿色健康差表与CaOx肾结石人群的染色体之间的关系实施了调查。差表组与CaOx结石人群的取得性之间的关系表答方式染色体（DEGs）挑选标准规定为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共挑选到3783个染色体时有发生取得变化无常，表中3379个（89.4%）染色体表答方式调整，404个（10.6%）染色体表答方式再降（图2A）。对DEGs实施聚类分析剖析法剖析，热图表示了前10个被选中DEGs的二维逐层聚类分析剖析法功能（图2B）。紧接着，调查者管理经由GeneCards数据表格表示库劳动力鉴别了370个有机会与CaOx肾结石有关的的染色体，排列前20位的分析染色体举例有关的性评估图示2C图示。重要在于看到丁酸改善CaOx肾结石的重要靶点，调查者管理将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石有关的染色体整理实现半个个Venn图。终于，CYP2C9被敲定为丁酸的影响CaOx肾结石的风险靶点(图2D)。因此，调查者管理还实施了丁酸与CYP2C9的氧分子指导，CYP2C9的两个蛋白质残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸之间用，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在进行互联网药理学学預测CYP2C9是丁酸直接影响CaOx肾结石的靶基因组后，科学研究人工还确认癌人体细胞科学试验灵魂存在了CYP2C9可减少草酸诱惑的HK-2癌人体细胞的ROS技术水平、真菌感染挤压伤和凋亡。

图2| 大多据库联手具体分析分析预测CYP2C9是丁酸做用于CaOx肾结石的靶人类基因

科研导致

本研究分析首要发掘丁酸在身体之外和体里均能限制CaOx肾结石建模的空气氧化物应激性性和发炎伤害，然后凭借网上药理学学学淘汰赢得丁酸不良影响CaOx肾结石的意向靶点——CYP2C9，最后一步凭借内部实验报告否认CYP2C9在草酸盐诱导型的HK-2内部ROS技術应用水平、发炎伤害和凋亡。等发掘呈现丁酸很有可能凭借限制CYP2C9来限制CaOx肾结石的空气氧化物应激性性，得到缓解发炎伤害。这一个步骤中拜谱微生态学打造了网上药理学学学技術应用工作，最后拜谱微生态学可上升完美完整的人类基因组学、球蛋白质含量组学、产生组学等几组学类产品及技術应用工作，欢迎图片详询了解！ 参考选取论文参考文献：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.